制藥工程分：化學制藥、生物制藥。本專業學生主要學習有機化學、分析化學、物理化學、生物化學，人體解剖生理學，化工原理、藥物化學、毒理學、藥理學、制藥工藝學和制藥專業設備等方面的基本理論和基本知識，受到化學與化工實驗技能、工程實踐、計算機應用、科學研究與工程設計方法的基本訓練，具有對醫藥產品的生產、工程設計、新藥的研制與開發的基本能力。

20世紀末基因組計劃的成功，系統生物學進入了細胞信號傳導與基因表達調控的研究水平，基于系統生物學的遺傳工程 - 合成生物學在21世紀興起，開創了系統生物技術篩選藥物與代銷工程制藥產業，2003年美國成功實現了青篙素在酵母細胞中的工程化微生物工程開發。

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